Methodenspektrum

Methodenspektrum

In der AG Blut-Hirn-Schranke sind alle gängigen molekularen Techniken etabliert und werden den Wissenschaftlern zur Verfügung gestellt.

Molekularbiologische Methoden

  • Nukleinsäureisolierung
  • PCR
  • Real-Time PCR
  • Klonierung
  • Hefe-Zwei-Hybrid-System
  • Mutagenese
  • Luciferase-Activity-Assay
  • Chromatin

Biochemische Methoden

  • Western Blot
  • rekombinante Expression
  • Polyacrylamidgelelektrophorese
  • Immunoprezipitation
  • Protein-Immunopräzipitation
  • Zellfraktionierung

Zellbiologischen Methoden

  • Isolierung und Kultivierung von primären und immortalisierten mikrovakulären Endothelzellen (EZ)
  • Transfektion
  • Immunozytochemie
  • Messungen des Transendothelialen Elektrischen Wiederstands und der Durchlässigkeit, in vitro Krankheitsmodelle (Schlaganfall, Schädel-Hirntrauma, Entzündung, Komorbiditäten, Herzerkrankungen, Metastasierung und Alterungsprozesse)

Methoden der Bioinformatik

  • Molecular dynamics methods: GROMACS, LAMMPS, AMBER, OCTA, Desmond, NAMD, PLUMED, etc.
  • Quantum mechanics methods: Quantum Espresso, ABINIT, CP2K, XMD, Virtual NanoLab, SIESTA, ORCA, Gaussian, MOPAC, TeraChem, Q-Chem, etc.
  • Molecular docking algorithms: AutoDock, Vina, GOLD, MOE Dock, PLANTS, GEMDOCK, FRED, DOCK6, Glide, SwissDock, HADDOCK, etc.
  • Image processing algorithms: OVITO, AtomEye, IQmol, Molden, PyMol, Marvin, VMD, Avogadro, Chimera, Coot, etc.
  • Biostatistics: R, MATLAB, SigmaPlot, Gnuplot, Grace, GraphPad Prism, etc.
  • Programming: Python, Perl, C, Bash, etc.
  • PK/PD and pathway analysis: Monolix, Berkeley Madonna, Phoenix WinNonlin, Cytoscape, R, Bioconductor, etc.
  • Rational drug design algorithms: DelG-to-Kd converter, IC50-to-pIC50 converter

Kontakt, Öffnungszeiten, Sprechzeiten

Telefon:
Direktor:
Univ.-Prof. Dr. med. Dr. h.c. Norbert Roewer
+49 931 201-30005

E-Mail:
an_direktion@ ukw.de

Fax:
+49 931 201-30019

 

 


Anschrift:

Klinik und Poliklinik für Anästhesiologie | Zentrum Operative Medizin (ZOM) | Oberdürrbacher Straße 6 | Haus A2 | 97080 Würzburg | Deutschland